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[![Build Status](https://travis-ci.com/liibre/coronabr.svg?branch=master)](https://travis-ci.com/liibre/coronabr)
# Download de dados de COVID-19 no Brasil
<img src="https://raw.githubusercontent.com/liibre/pkg_logos/master/figs/logo_coronabr.png" align="right" alt="" width="120" />
__coronabr__ é um pacote de [R](https://www.r-project.org/) para fazer _download_ e visualizar os dados dos casos diários de coronavírus (COVID-19) disponibilizados por diferentes fontes:
- [Ministério da Saúde](http://plataforma.saude.gov.br/novocoronavirus/#COVID-19-brazil);
- [Brasil I/O](https://brasil.io/dataset/covid19/caso);
- [Johns Hopkins University](https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19)
## Nosso objetivo
O nosso objetivo é facilitar o acesso aos dados de diferentes fontes,
usando ferramentas de acesso aberto e que permitam reprodutibilidade.
O código é aberto. Entre em [como
usar](https://liibre.github.io/coronabr/articles/coronabr.html) para um
exemplo de como utilizar o pacote. Compartilhe.
Fazemos ciência aberta, democrática e reprodutível. Este é um trabalho
em desenvolvimento. Para entender como contribuir, clique
[aqui](https://liibre.github.io/coronabr/CONTRIBUTING.html).
## Aviso\!
Disponibilizamos aqui atualizações dos gráficos. Sabemos que
deve haver maneiras responsáveis de apresentar estes dados e que as
comparações entre regiões e países dependem de muitas variáveis.
Os dados são referentes aos casos notificados. É sabido que temos subnotificação e atraso nas notificações. Assim, mais do que nunca, não refletem a epidemia em si.
## Sobre os dados
Antes de mais nada, declaramos nossa postura alinhada com as ideias de uma ciência de dados responsável, compromissada e feminista. Somos pessoas alinhadas com o [manifest-no](https://www.manifestno.com/), refutamos regimes de dados prejudiciais e nos comprometemos a novos futuros de dados.
Apesar de acreditarmos no acesso sem distinção a dados abertos, não recomendamos que toda análise que possa ser feita o seja. Ao se tratar de uma situação de saúde pública delicada, visualizações, extrapolações, e predições devem ser feitas com todo cuidado, lembrando que a qualidade dos dados é incerta e que todo dado diz respeito a uma pessoa.
No Brasil, a notificação de casos carrega consigo vieses espaciais, econômicos e de classe que não podem ser ignorados. Para ver modelos **responsáveis** de previsão do crescimento no número de casos veja o [Observatório COVID-19 Brasil](https://covid19br.github.io/index.html) (um grupo colaborativo de pessoas cientistas brasileiras) e o [Mapa de previsão da propagação da COVID-19 por contágio comunitário no Brasil](https://covid-19-risk.github.io/map/brazil/pt/).
### Nota sobre os dados disponibilizados pelo Ministério da Saúde
+ A partir de 2020-03-14, a notificação de casos graves de COVID-19 foca apenas nos casos graves que são atendidos nos hospitais.
+ Até 2020-03-18 o ministério de saúde brasileiro disponibilizou os dados de casos de coronavirus COVID-19 discriminados por estado na página http://plataforma.saude.gov.br/novocoronavirus/#COVID-19-brazil
+ Entre 2020-03-18 e 2020-03-25, a página original do Ministério da Saúde parou de funcionar e os dados de casos de coronavirus COVID-19 discriminados por estado foram divulgados em apresentações de powerpoint e PDFs no blog do Ministério. [Adriano Belisario](https://www.twitter.com/belisards) fez a compilação manual destes dados [neste repositório](https://github.com/belisards/coronabr)
+ A partir de 2020-03-26 o Ministério de Saúde brasileiro disponibilizou os dados de casos de coronavirus COVID-19 na página https://covid.saude.gov.br/
+ A partir de 2020-03-28 a opção de fazer _download_ da série histórica por casos voltou a estar disponível. Depois disso, o padrão tem mudado frequentemente, inclusive no formato de disponibilização dos dados que agora é em .xls e não mais .csv. Neste momento, temos uma função estável `get_corona_minsaude()` para o _download_ desses dados (instruções de como usar [aqui](https://liibre.github.io/coronabr/articles/minsaude.html)).
## Visualizando os dados
Importante lembrar que desde 2020-03-27 tem muitos testes sem resultados e que os dados não refletem a epidemia e sim as notificações - e que essas estão atrasadas devido ao atraso no resultado dos testes.
Entre [aqui](https://liibre.github.io/coronabr/articles/lac.html) para acompanhar os casos na América Latina (versão em espanhol [aqui](https://liibre.github.io/coronabr/articles/lac_es.html))
### Crescimento nacional no número de casos de COVID-19
<img src="https://raw.githubusercontent.com/liibre/coronabr/master/docs/articles/articles/graficos_files/figure-html/fig-casos-1.png" align="center" alt="" width="600" />
### Entendendo o aumento diário de COVID-19
<img src="https://raw.githubusercontent.com/liibre/coronabr/master/docs/articles/articles/graficos_files/figure-html/fig-perc-1.png" align="center" alt="" width="600" />
### Crescimento do número de casos de COVID-19 nos estados mais afetados
<img src="https://raw.githubusercontent.com/liibre/coronabr/master/docs/articles/articles/graficos_files/figure-html/estados-1.png" align="center" alt="" width="600" />
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### Número de casos por estado brasileiro
<img src="https://raw.githubusercontent.com/liibre/coronabr/master/docs/articlfes/graficos_files/figure-html/mapa1-1.png" align="center" alt="" width="600" />
### Evolução do número de casos por estado
<img src="https://raw.githubusercontent.com/liibre/coronabr/master/vignettes/figs/anim.gif" align="center" alt="" width="600" />
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## Para saber mais:
- [Observatório Covid-19 BR](https://covid19br.github.io/)
- Dados compilados pelo Brasil I/O, [Álvaro Justen](https://github.com/turicas/) e colaboradores [aqui](https://brasil.io/dataset/covid19/caso)
- [John Hopkins Coronavirus COVID-19 Global Cases](https://coronavirus.jhu.edu/map.html)
- [Mapa de previsão da propagação da COVID-19 por contágio comunitário no Brasil](https://covid-19-risk.github.io/map/brazil/pt/)
- [covid19br](https://paternogbc.github.io/covid19br/index.html), o pacote de R [Gustavo Palermo](https://github.com/paternogbc) para acompanhar os dados de novos casos no Brasil
- [Portal da Fiocruz](https://portal.fiocruz.br/coronavirus)
- [Site oficial da Organização Mundial da Saúde (em inglês)](https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019)
- [Tira dúvidas do Instituto Butantan](http://coronavirus.butantan.gov.br/)
- [Banco de dados aberto COVID-19 (em inglês)](https://pages.semanticscholar.org/coronavirus-research])
- [Atualização mundial do número de casos](https://www.worldometers.info/coronavirus/)
- [Dez considerações antes de criar mais um gráfico sobre o COVID-19 (em inglês)](https://medium.com/nightingale/ten-considerations-before-you-create-another-chart-about-covid-19-27d3bd691be8)
- Siga o **Atila Iamarino** no [youtube](https://www.youtube.com/channel/UCSTlOTcyUmzvhQi6F8lFi5w), [Instagram](www.instagram.com/oatila), [twitter](https://twitter.com/oatila) ou [telegram](https://t.me/corona_atila). Tem também um [fórum brasileiro de reddit](https://www.reddit.com/r/coronabr/) com muita informação.
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