Parallel HuMAnN v1.1

• Update HuMAnN3.0 with parallel computing
• Speed up to 2x-4x times
• compatible with HuMAnN 3.0

说明

• 基于HuMAnN 3.0版本优化，兼容HuMAnN 3.0版本
• 主要使用Python Multiprocessing优化大文件处理流程
• 优化部分文件IO过程
• 整体实现2-4倍的加速
• 移除HuMAnN 3中memory-use参数的支持，影响运行效率

如何使用？

请参见wiki

TODO

• 继续优化Diamond Output post-processing
• 在更多数据集上测试结果一致性

HUMAnN Src

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• For complete documentation, please see the HUMAnN User Manual.

• Please direct questions to the HUMAnN google group (subscribe to receive HUMAnN news).

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